Žádost o uznání bude podávána prostřednictvím Systému Administrace a postoupena na MZČR. MZČR vyřeší žádost mimo systém, rozhodnutí následně vloží do Systému Administrace a také zapíše do registru. Systém Administrace si dále načítá informace z registru NR-ZP. Dokud nebude v NR-ZP záznam, není možné žadatele zařadit do specializačního vzdělávání. Na tuto skutečnost bude lékař v Systému Administrace upozorněn. U každého vyplňování žádosti bude patrné, zda ji může lékař odeslat v závislosti na načtených záznamech z NR-ZP nebo po vložení rozhodnutí.